Реалбест рнк sars cov 2 инструкция

Своевременная и качественная диагностика – один из ключевых факторов в борьбе с COVID-19: диагностика необходима и для оценки общей эпидемиологической ситуации, и в случае принятия решения по каждому конкретному пациенту. По данным сайта стопкоронавирус.рф на 12.05.2020 г. проведено более более 5,8  миллионов тестов на наличие нового коронавируса. Цифра огромная. Однако, насколько достоверны результаты? Появляется все больше историй о типичной картине COVID-19 при отрицательных анализах. Почему так может происходить?

Какие тест-системы сейчас используются, каковы их достоинства и недостатки, и почему некоторые регионы страны переходят на диагностику с помощью компьютерной томографии разберемся в этой статье. Все это важно знать фармацевтическим работникам, чтобы быть в курсе текущих событий и грамотно отвечать на вопросы, которые клиенты неизбежно задают и будут задавать людям в белых халатах.

Сначала поговорим о ПЦР-тестах, которые специфически выявляют РНК вируса в пробах. 

Взятие пробы для ПЦР

Показано, что для выявления нового коронавируса подходят смывы из носоглотки – из ротоглотки вероятность ложноотрицательного анализа немного выше [1]. Один из важнейших аспектов – время взятия материала. Проведенные исследования показывают, что при взятии материала у больного в первый день проявления симптомов COVID-19 положительный диагноз поставят с вероятностью 94 %, а вот к 10-му дню это будет всего лишь 67 %! [2].

Существует четкая закономерность: чем позже от возникновения симптомов взят материал, тем меньше шансов обнаружить в нем вирусную РНК.

Есть и хорошие новости: в течение первой недели от возникновения симптомов носоглоточные смывы имеют порядок от 100 000 до 1 000 000 копий вирусной РНК в 1 мл, что делает их легко обнаруживаемыми даже не самыми чувствительными системами. Исследования также показали, что вирусная нагрузка в верхних дыхательных путях может быть одинаковой у людей с проявленной симптоматикой и при бессимптомном течении болезни [3].

Транспортировка и хранение проб для ПЦР

Хранить образцы рекомендуется при температуре 2-8°C не больше 72 часов (более длительное хранение требует заморозки на -70°С и ниже) [4]. Соответственно, при нарушении температурного режима вероятность ложноотрицательного результата также повышается. Из-за перегруженности лабораторий, можно предположить, что большая часть образцов не хранится перед анализом надлежащим образом.

Точность разных ПЦР-тест-систем 

После попадания образцов в лабораторию правильность диагноза будет зависеть во многом от тест-системы, которую там используют. На сегодняшний день помимо двух тест-систем, разработанных еще в январе в ГНЦВБ «Вектор», зарегистрировано 8 ПЦР-тест систем [5]:

•   АмплиТест SARS-CoV-2; разработан ФГБУ «Центр стратегического планирования» (ЦСП) Минздрава РФ, Москва;
•   АмплиСенс CoVs-Bat-FL (ЦНИИ Эпидемиологии Роспотребнадзора, Москва);
•   Поливир SARS-CoV-2 (ООО «НПФ «Литех», Москва совместно с ФМБА и НИЦЭМ им. Гамалеи);
•   РеалБест РНК SARS-CoV-2 (АО «Вектор-Бест», Новосибирск, Кольцово);
•   набор реагентов для выявления РНК коронавирусов SARS-CoV-2 и подобных SARS-CoV (ООО «ДНК-Технология-ТС», Москва);
•   набор реагентов для выявления РНК коронавируса SARS-CoV-2 (ФГБУ «48 ЦНИИ» Минобороны России);
•   SBT-DX-SARS-CoV-2 (ООО «Система-БиоТех»);
•   набор ООО «МедипалТех» из Дубны (производителем указано ООО «Амплитек»).

Из них системы «Вектора» и «Вектор-Беста» (последняя через сеть лабораторий «Инвитро» [6]) используются для исследования проб от государственных медицинских организаций. Здесь хочется отметить, что система «Вектора» не содержит в своем составе внутреннего контрольного образца, который должен добавляться во все пробы для контроля правильности выделения РНК и реакции обратной транскрипции [7]. Отсутствие такого контроля может также потенциально приводить к некоторому количеству ложноотрицательных результатов. Хорошая новость заключается в том, что остальные зарегистрированные тест-системы имеют в своем составе внутренний контроль, а также, по-видимому, обладают более высокой чувствительностью, т.е. дают меньше ложноотрицательных результатов.

Что касается частных клиник, то компании «Хеликс» [8] и «Гемотест» [9] заявляют, что они используют систему ГНЦВБ «Вектор», в то время как CMD и «Ситилаб » используют более современные системы ЦНИИ Эпидемиологии и ДНК-технологии, соответственно [10, 11].

Таким образом, в городах, где представлены сетевые лаборатории, есть возможность сдать анализ частным образом и надеяться на точность проведения процедуры. В первые дни появления симптоматики точность будет выше.

Экспресс-системы

Что касается экспресс-тест-систем, то есть опасения, что созданные в сжатые сроки «уникальные» тесты по своему качеству будут уступать системам, основанным на обычной ПЦР. Насколько надежны эти системы покажет время, однако уже сейчас количество ложноотрицательных результатов ПЦР в совокупности с длительностью ожидания результата привело к тому, что в клиниках страны диагноз стали ставить не на основе ПЦР-анализа, а на основе результатов компьютерной томографии (КТ).

КТ

Преимущество КТ-диагностики при наличии клинической картины – это  скорость постановки диагноза и более высокая чувствительность по сравнению с реальностью ПЦР-диагностики: 97,2 % против 83,3 % согласно данным небольшого китайского исследования [12]. Начиная с 4-5 дня заболевания можно различить так называемый симптом «матового стекла», на стадии прогрессирования такие участки  консолидируются,  возникает симптом «булыжной мостовой», «обратного ореола», а в пиковая стадии – «белое легкое» [13]. Возникает закономерный вопрос: отличается ли картина пневмонии, вызванной именно новым коронавирусом, от заболеваний другой вирусной природы. Ответ – нет. Вирусные пневмонии, будь то аденовирус, грипп или другие респираторные вирусы, выглядят на КТ одинаково.

Однако в условиях пандемии, когда подавляющее большинство вирусных пневмоний имеют коронавирусную природу, использование КТ для диагностики становится более чем оправданным. В последней версии методических рекомендаций Минздрава по профилактике, диагностике и лечению COVID-19 указано, что «наличие клинических проявлений в сочетании с характерными изменениями в легких по данным КТ или обзорной рентгенографии органов грудной клетки вне зависимости от результатов однократного лабораторного исследования на наличие РНК SARS-CoV-2 и эпидемиологического анамнеза» является клинически подтвержденным случаем COVID-19 [14]. Отметим также, что объем поражения легких при РГ и КТ может не иметь прямой корреляции с клинической тяжестью заболевания. 

ИФА (иммуноферментный анализ)

ПЦР-тест-системы, как и КТ-диагностика выявляет COVID-19 в острой фазе. Однако весьма актуальна и информация об уже переболевших, на основании которой можно судить об охвате населения заболеванием, а также о числе бессимптомных случаев. Ответы на эти, а также на многие другие вопросы, может дать тест-система на антитела. На сегодняшний день разработкой таких тест-систем помимо «Вектора» занимаются такие организации как «Вектор-Бест», «НПО «Диагностические системы», ФНКЦ ФХМ ФМБА России, «МБС-Технологии», а также «Генетико» и Институт молекулярной биологии РАН [5]. К сожалению, тест-системы на антитела требуют намного больших усилий и времени на разработку, чем ПЦР-системы, а их чувствительность и специфичность оставляет желать лучшего. Так, проведенное в США исследование доступных система на антитела показало, что лишь 3 из 14 систем дают надежные результаты (т.е. не более 1% ложноположительных результатов), но при этом их чувствительность не превышает 90% относительно положительных контрольных образцов [15]. Какова будет чувствительность и специфичность разрабатываемых российских систем – пока неизвестно.

Итак, самое разумное, что вы можете сказать клиентам:

1. Если у вас первые пять дней симптомов – вполне можно сдать пробы для ПЦР-диагностики в частных центрах, в идеале, заказав выезд специалистов на дом. Желательно тестироваться в тех лабораториях, которые используют системы с контрольными образцами, о чем мы писали выше. 
2. Если тест дал отрицательный результат или прошло больше пяти дней от начала болезни, а симптомы сохраняются, то в этом случае можно сделать КТ, при этом соблюдать все меры предосторожности, ведь в очереди запросто могут оказаться люди с новой коронавирусной инфекцией. 
3. Проводить ИФА при текущей низкой точности – едва ли имеет смысл. 
4. Если у вас нет симптомов, но был контакт, то можно пройти ПЦР-диагностику, но лучше всего на 14 дней уйти на самоизоляцию и наблюдать за самочувствием.

Регистрируйся на нашем сайте и получай доступ ко всем материалам о COVID-19 в специальном разделе.

Самое важное по теме: антисептик оптики для рук, гигиена рук, дезинфекция в аптеке, правила использования масок, мифы и факты о коронавирусе, фармконсултирование по жаропонижающим и гипотензивным во время пандемии. 

Отвечаем на вопросы в прямых эфирах Вконтакте: https://vk.com/pharmznanie 

Обсудить последние новости со всеми коллегами России вы можете в чатах:

• Telegram: https://tglink.ru/pharmorden
• ВКонтакте: https://vk.me/join/AJQ1d_D2XxaDy9IdzL0e6EqH

Своевременная и качественная диагностика —  один из ключевых факторов в борьбе с COVID-19: диагностика необходима и для оценки общей эпидемиологической ситуации, и в случае принятия решения по каждому конкретному пациенту. По данным сайта стопкоронавирус.рф на 12.05.2020 проведено более более 5,8  миллионов тестов на наличие нового коронавируса. Цифра огромная. Однако, насколько достоверны результаты? Появляется все больше историй о типичной картине COVID-19 при отрицательных анализах. Почему так может происходить? Какие тест-системы сейчас используются, каковы их достоинства и недостатки, и почему некоторые регионы страны переходят на диагностику с помощью компьютерной томографии разберемся в этой статье . Все это важно знать клиницистам, чтобы быть в курсе текущих событий и грамотно отвечать на вопросы, которые пациенты задают и будут задавать.

Сначала поговорим о ПЦР-тестах, которые специфически выявляют РНК вируса в пробах. 

Взятие пробы для ПЦР

Показано, что для выявления нового коронавируса подходят смывы из носоглотки —  из ротоглотки вероятность ложноотрицательного анализа немного выше [1]. Один из важнейших аспектов —  время взятия материала. Проведенные исследования показывают, что при взятии материала у больного в первый день проявления симптомов COVID-19 положительный диагноз поставят с вероятностью 94 %, а вот к 10-му дню это будет всего лишь 67 %! [2].

Существует четкая закономерность: чем позже от возникновения симптомов взят материал, тем меньше шансов обнаружить в нем вирусную РНК.

Есть и хорошие новости: в течение первой недели от возникновения симптомов носоглоточные смывы имеют порядок от 10⁵ до 10⁶ копий вирусной РНК в 1 мл, что делает их легко обнаруживаемыми даже не самыми чувствительными системами. Исследования также показали, что вирусная нагрузка в верхних дыхательных путях может быть одинаковой у людей с проявленной симптоматикой и при бессимптомном течении болезни [3].

Транспортировка и хранение проб для ПЦР

Хранить образцы рекомендуется при температуре 2-8°C не больше 72 часов (более длительное хранение требует заморозки на -70°С и ниже) [4]. Соответственно, при нарушении температурного режима вероятность ложноотрицательного результата также повышается. Из-за перегруженности лабораторий, можно предположить, что большая часть образцов не хранится перед анализом надлежащим образом.

Точность разных ПЦР-тест-систем 

После попадания образцов в лабораторию правильность диагноза будет зависеть во многом от тест-системы, которую там используют. На сегодняшний день помимо двух тест-систем, разработанных еще в январе в ГНЦВБ «Вектор», зарегистрировано 8 ПЦР-тест систем [5]:

•  АмплиТест SARS-CoV-2; разработан ФГБУ «Центр стратегического планирования» (ЦСП) Минздрава РФ, Москва;
•   АмплиСенс CoVs-Bat-FL (ЦНИИ Эпидемиологии Роспотребнадзора, Москва);
•   Поливир SARS-CoV-2 (ООО «НПФ «Литех», Москва совместно с ФМБА и НИЦЭМ им. Гамалеи);
•   РеалБест РНК SARS-CoV-2 (АО «Вектор-Бест», Новосибирск, Кольцово);
•   набор реагентов для выявления РНК коронавирусов SARS-CoV-2 и подобных SARS-CoV (ООО «ДНК-Технология-ТС», Москва);
•   набор реагентов для выявления РНК коронавируса SARS-CoV-2 (ФГБУ «48 ЦНИИ» Минобороны России);
•   SBT-DX-SARS-CoV-2 (ООО «Система-БиоТех»);
•   набор ООО «МедипалТех» из Дубны (производителем указано ООО «Амплитек»).

Из них системы «Вектора» и «Вектор-беста» (последняя через сеть лабораторий «Инвитро» [6]) используются для исследования проб от государственных медицинских учреждений, поликлиник и больниц. Здесь хочется отметить, что система «Вектора» не содержит в своем составе внутреннего контрольного образца, который должен добавляться во все пробы для контроля правильности выделения РНК и реакции обратной транскрипции [7]. Отсутствие такого контроля может также потенциально приводить к некоторому количеству ложноотрицательных результатов. Хорошая новость заключается в том, что остальные зарегистрированные тест-системы имеют в своем составе внутренний контроль, а также, по-видимому, обладают более высокой чувствительностью, т.е. дают меньше ложноотрицательных результатов.

Что касается частных клиник, то компании «Хеликс» [8] и «Гемотест» [9] заявляют, что они используют систему ГНЦВБ «Вектор», в то время как CMD и «Ситилаб » используют более современные системы ЦНИИ Эпидемиологии и ДНК-технологии, соответственно [10, 11].

Таким образом, в городах, где представлены сетевые лаборатории, есть возможность сдать анализ частным образом и надеяться на точность проведения процедуры. В первые дни появления симптоматики точность будет выше.

Экспресс-системы

Что касается экспресс-тест-систем, то есть опасения, что созданные в сжатые сроки «уникальные» тесты по своему качеству будут уступать системам, основанным на обычной ПЦР. Насколько надежны эти системы покажет время, однако уже сейчас количество ложноотрицательных результатов ПЦР в совокупности с длительностью ожидания результата привело к тому, что в клиниках страны диагноз стали ставить не на основе ПЦР-анализа, а на основе результатов компьютерной томографии (КТ).

КТ

Преимущество КТ-диагностики при наличии клинической картины – это  скорость постановки диагноза и более высокая чувствительность по сравнению с реальностью ПЦР-диагностики: 97,2 % против 83,3% согласно данным небольшого китайского исследования [12]. Начиная с 4-5 дня заболевания можно различить участки «матового стекла», на стадии прогрессирования такие участки  консолидируются,  возникает симптом «булыжной мостовой», «обратного гало», а в пиковая стадии — «белое легкое» [13]. Возникает закономерный вопрос: отличается ли картина пневмонии, вызванной именно новым коронавирусом, от заболеваний другой вирусной природы. Ответ — нет. Вирусные пневмонии, будь то аденовирус, грипп или другие респираторные вирусы, выглядят на КТ одинаково.

Однако в условиях пандемии, когда подавляющее большинство вирусных пневмоний имеют коронавирусную природу, использование КТ для диагностики становится более чем оправданным.

 В последней версии методических рекомендаций Минздрава по профилактике, диагностике и лечению COVID-19 указано, что «наличие клинических проявлений в сочетании с характерными изменениями в легких по данным КТ или обзорной рентгенографии органов грудной клетки вне зависимости от результатов однократного лабораторного исследования на наличие РНК SARS-CoV-2 и эпидемиологического анамнеза» является клинически подтвержденным случаем COVID-19 [14]. Отметим также, что объем поражения легких при РГ и КТ может не соотносится с тяжестью состояния пациента.

ИФА 

ПЦР-тест-системы, как и КТ-диагностика выявляет COVID-19 в острой фазе. Однако весьма актуальна и информация об уже переболевших, на основании которой можно судить об охвате населения заболеванием, а также о числе бессимптомных случаев. Ответы на эти, а также на многие другие вопросы, может дать тест-система на антитела. На сегодняшний день разрабаткой таких тест-систем помимо «Вектора» занимаются такие организации как «Вектор-Бест», ООО «НПО «Диагностические системы», ФНКЦ ФХМ ФМБА России, «МБС-Технологии», а также «Генетико» и Институт молекулярной биологии РАН [5]. К сожалению, тест-системы на антитела требуют намного больших усилий и времени на разработку, чем ПЦР-системы, а их чувствительность и специфичность оставляет желать лучшего. Так, проведенное в США исследование доступных система на антитела показало, что лишь 3 из 14 систем дают надежные результаты (т.е. не более 1% ложноположительных результатов), но при этом их чувствительность не превышает 90% относительно положительных контрольных образцов [15]. Какова будет чувствительность и специфичность разрабатываемых российских систем — пока неизвестно.

Сделаем краткие практические выводы:

1. В первые пять дней болезни — ПЦР-диагностика будет достаточно эффективна. Идеальный вариант — тестирование с выездом на дом в тех лабораториях, которые используют системы с контрольными образцами,  о чем мы писали выше. 
2. Если тест дал отрицательный результат или прошло больше пяти дней от начала болезни, а симптомы сохраняются, то в этом случае поможет с диагностикой КТ; при этом пациентам важно напомнить о соблюдении всех меры предосторожности при нахождении в медицинских организациях. 
3. Проводить ИФА при текущей низкой точности — едва ли имеет смысл. 
4. Если симптомов нет, но был контакт, в принципе можно пройти ПЦР-диагностику, но лучше всего на 14 дней уйти на самоизоляцию и наблюдать за самочувствием.

Парадоксальным образом, нам известны истории, когда самих врачей, контактных по COVID-19, тестируют далеко не всегда и на самоизоляцию никто не отправляет. Вопросы финансирования диагностики и конечно кадровой политики (кто вообще останется работать?) не решены. Поэтому, еще раз напоминаем о важности соблюдения всех профилактических мер при контакте с пациентами.

Отвечаем на вопросы о системе НМиФО в прямых эфирах Вконтакте: https://vk.com/medznanie_ru 

Обсудить последние новости со всеми коллегами России вы можете в чатах:

• WhatsApp: https://chat.whatsapp.com/Izj3ZQ7aI36KK8e2dCjcm4
• Telegram: https://tglink.ru/joinchat/GWBPCkkLipQUnTbXrKqzGA
• ВКонтакте: https://vk.me/join/AJQ1dzabQRfHvl5Y2AOVUsgJ

Регистрируйся на нашем сайте и получай доступ к актуальным образовательным вебинарам

Также читайте статьи: Каким будет сценарий эпидемии COVID-19 в РФ (графики для РФ, Италии, Южной Кореи и США), Правда и мифы о коронавирусе (COVID 19), Вопрос жаропонижающих при коронавирусе: только не НПВП или почему бы и нет?

Штаммы коронавируса SARS-CoV-2: причины появления, симптомы, диагностика и способы лечения.

Определение

Коронавирусы — это семейство вирусов – носителей цепи рибонуклеиновой кислоты (РНК), содержащей всю информацию для репликации (копирования). Это семейство включает 43 вида. Они получили свое название из-за наличия шиповидных отростков, напоминающих солнечную корону. Поражают млекопитающих (включая человека), птиц и земноводных.

Новый штамм коронавируса, заразный для людей и стремительно распространившийся среди населения планеты, впервые появился в китайской провинции Хубэй в конце 2019 года. Его назвали SARS-CoV-2 (Severe acute respiratory syndrome-related coronavirus-2), а заболевание, которое он вызывает, – COVID-19.

Геном SARS-CoV-2 – это длинная последовательность РНК, состоящая примерно из 30 тысяч «знаков», идущих друг за другом в строгом порядке. Когда вирус реплицируется, или воспроизводит копии самого себя, этот порядок немного изменяется. Такие единичные изменения называют «мутациями».

Большинство мутаций не дают вирусу никаких преимуществ. Но некоторые оказываются вредными, и тогда у него появляются новые возможности, например, способность распространяться быстрее.

Вирусы с одной или несколькими новыми мутациями называются «вариантами» и обозначаются буквами греческого алфавита. Исходя из их распространенности среди населения и данных о биологических свойствах, выделяют варианты, вызывающие озабоченность врачей или интерес ученых.

Варианты, вызывающие озабоченность, имеют последствия для здоровья населения обычно в связи с наличием одного или нескольких из следующих свойств:

• более высокая заразность (контагиозность или трансмиссивность);
• более тяжелое течение заболевания (патогенность);
• труднее нейтрализуются антителами (в том числе антителами, возникшими в результате предыдущей инфекции или вакцинации, и терапевтическими моноклональными антителами);
• труднее обнаруживаются диагностическими тестами, такими как ПЦР (полимеразная цепная реакция).

На сегодняшний день к вариантам вируса SARS-CoV-2, которые вызывают озабоченность, отнесены Альфа, Бета, Гамма, Дельта и Омикрон. Варианты Эта, Лямбда и Мю относят к вариантам, вызывающим интерес ученых. Мы будем называть их штаммами, поскольку так более привычно.

Британский штамм (вариант) Альфа выявили в октябре 2020 года. Новый штамм распространялся в полтора раза быстрее оригинального SARS-CoV-2, обнаруженного в Ухани (заразность штамма Альфа выше примерно на 60%). Он был более опасен для жизни, и заболевшие чаще попадали на лечение в стационары. Уровень летальности штамма Альфа в среднем на 59% выше, чем у штамма из Уханя. На сегодняшний день случаев данного варианта заболевания уже не наблюдается.

Южноафриканский штамм (вариант) Бета обнаружен в мае 2020 года. Среди всех известных штаммов этот вариант коронавируса считается наименее заразным, впрочем, он все равно распространяется быстрее, чем уханьский. Его трансмиссивность оценивается в среднем в 25%. Бета-штамм почти вдвое чаще приводит к госпитализации, чем исходный коронавирус, он более опасен для жизни, чем штаммы Альфа и Гамма. Отличается тем, что им гораздо чаще заражаются молодые и исходно здоровые люди. Этот штамм совершил большой эволюционный скачок и прошел около 50 мутаций, 30 из которых коснулись так называемого «спайк-белка» – шипов на оболочке вируса, с помощью которых он проникает в клетки человеческого организма. Другая часть вируса, которая вступает в контакт с организмом, мутировала уже после попадания в клетку 10 раз, что ослабляет действие всех имеющихся вакцин, направленное на нейтрализацию шипов.

Бразильский штамм (вариант) Гамма обнаружен в ноябре 2020 года. Он считается более заразным, чем варианты Альфа и Бета. Его трансмиссивность оценивается в среднем в 38%. Штамм Гамма примерно на 30% чаще приводит к госпитализации, чем оригинальный SARS-CoV-2. Он выделяется среди других штаммов повышенным риском повторного заболевания. Кроме того, Гамма-штамм приводит к смертельному исходу в среднем на 50% чаще, чем исходный коронавирус.

Индийский штамм (вариант) Дельта выделен в октябре 2020 года. Штамм Дельта считается на 97% заразнее оригинального SARS-CoV-2 и на 60% — варианта Альфа. Каждый носитель инфекции способен заразить 5–6 человек, инкубационный период сократился в среднем до пяти дней. В случае с Дельтой самым уязвимым возрастом принято считать 14–29 лет (это может быть объяснено тем, что молодежь социально более активна). По состоянию на 14 декабря 2021 года на штамм Дельта приходилось около 70% всех заражений.

Из известных штаммов именно этот вариант Дельта приводит к наибольшему числу госпитализаций. Шанс попасть в больницу, заразившись этим штаммом SARS-CoV-2, выше на 85% по сравнению с Альфой.

Летальность Дельты достигает 137%, если сравнивать с уханьским вирусом, и 85% – с Альфа-штаммом. За все время своего существования вариант Дельта не приобрел значимых мутаций и не претерпел никаких изменений.
Штамм Омикрон был впервые обнаружен в Южно-Африканской Республике и Ботсване в ноябре 2021 года. Омикрон в несколько раз заразнее всех предыдущих штаммов, однако смертность от него пропорционально ниже. При этом именно Омикрон стал доминировать в России. Его выявляют у 70% вновь заболевших. Омикрон содержит в себе практически все мутации, которые делали его предшественников более заразными. Он обладает некоторым потенциалом ухода от иммунного ответа, от всех известных антител, вакцин и моноклональных антител. Каждая мутация, в результате которой одна аминокислота меняется на другую, выпадает или, наоборот, добавляется, приводит к изменениям той или иной части белка, в котором происходят эти изменения. Измененная часть может стать невидимой для антител, выработанных у вакцинированных или у тех, кто переболел другими штаммами коронавируса. Антитела очень точно узнают «свои» поверхности спайка и прикрепляются к ним. Смена формы белка может привести к тому, что антитела не заметят «врага» и не смогут выполнить защитные функции. Именно с этим связано одно из главных опасений экспертов – значительная часть антител, эффективных против существующих штаммов, могут оказаться бесполезными против Омикрона.

Омикрон стал причиной новой волны заболеваемости даже среди тех, кто уже переболел коронавирусом ранее.

Сопоставление «прогремевших» на весь мир штаммов коронавируса позволяет заподозрить следующие тенденции: заразность растет в геометрической прогрессии, развивается болезнь все стремительнее, однако не до конца ясно, что происходит с тяжестью течения инфекции. Не исключено, что она продолжит снижаться. Вирусу, чтобы эффективно размножаться, убивать хозяина не нужно. Хорошо приспособленный к человеческому организму вирус учится уходить от иммунного ответа, но при этом начинает хуже поражать рецепторы клеток.

Вирусы часто эволюционируют в сторону смягчения течения заболевания и становятся более живучими и заразными, но менее летальными.

Вероятность появления новых штаммов коронавируса существует. Но некоторые исследователи считают, что если Омикрон будет быстрее распространяться и легче переноситься, то эпидемия должна закончиться в ближайшем будущем. Это не говорит о том, что Омикрон совершенно безопасен, поскольку определенный процент летальности у него все-таки есть.

Существует еще одна точка зрения относительно появления штамма Омикрон, основанная на том, что этот штамм не произошел от Дельты, а появился из совершенно другой части генеалогического дерева вируса. Ученые, которые ее придерживаются, считают, что, когда возникают два столь различающихся между собой штамма вируса, как Омикрон и Дельта, то уже не идет речь о вытеснении одного штамма другим. Вместо этого два подвида учатся сосуществовать в одном хозяине. При этом против Омикрона слабее действует Дельта-иммунитет, а против Дельты слабее работает иммунная система, встречавшаяся с Омикроном. Пока эта точка зрения не имеет строго научного обоснования, а существует в виде гипотезы. Но если она окажется верна, то даже при повсеместном распространении штамма Омикрон штамм Дельта никуда не исчезнет. То есть могут образоваться волны в противофазе: Дельта, потом Омикрон, потом снова Дельта, и так далее.

Симптомы новой коронавирусной инфекции, вызванной различными штаммами

Известно, что коронавирусы способны вызывать целый ряд заболеваний, которые проявляются респираторными симптомами обычной простуды, признаками тяжелого острого респираторного синдрома или смертельно опасной атипичной пневмонией.

Мутации вируса влияют на течение инфекционного процесса.

Штаммам коронавируса Альфа, Бэта и Гамма присущи такие симптомы, как высокая температура, изнурительный кашель, изменения во вкусовой чувствительности, потеря обоняния.

У индийского штамма Дельта есть собственные отличительные характеристики. Инкубационный период сократился, а срок выведения вируса из организма, напротив, увеличился до 13–15 дней, что затрудняет определение факта выздоровления. Штамм часто вызывает проблемы с желудком и кишечником, боль в животе, рвоту, тошноту, обильные выделения из носа и прочее. При этом у заболевших крайне редко нарушается обоняние и бывает кашель.

Омикрон-штамм не проникает в легкие и остается в верхних дыхательных путях. По этой причине он проявляется болью в горле, осиплостью голоса, сухим кашлем, заложенностью носа, насморком, высокой температурой, ощущением тяжести в грудной клетке, одышкой, признаками конъюнктивита и повышением пульса. Сатурация (насыщение тканей кислородом) наблюдается на уровне 95%.

В среднем у 50% пациентов, инфицированных Омикроном, заболевание протекает бессимптомно. А еще у 40% — в легкой форме ОРВИ.

В отличие от симптомов, вызываемых Дельта-штаммом, при заражении Омикроном больных сильнее беспокоят пульсирующая головная боль, слабость и миалгия (боль в мышцах), у детей могут появиться высыпания на коже. Заметим, что именно Омикрон-штамм оказался самым заразным для детей. У маленьких пациентов наблюдаются симптомы крупа, бронхиальной обструкции, а также бронхиолиты (поражение мелких бронхиол, сопровождающиеся дыхательной недостаточностью).

Диагностика новой коронавирусной инфекции, вызванной различными штаммами

С января 2022 года в России стали циркулировать два преобладающих штамма: Дельта и Омикрон. При осложненном течении заболевания возникает необходимость определения штамма с целью выбора оптимальной стратегии лечения. В Роспотребнадзоре сообщили, что на 1 марта 2022 года 97% всех подтвержденных случаев СOVID-19 протекают как ОРВИ или без симптомов

Экспресс-тест, ПЦР, РНК вируса SARS-CoV-2, мазок. Определение РНК вируса SARS-CoV-2 (все виды известных штаммов, включая Delta и Omicron).

Лечение новой коронавирусной инфекции, вызванной различными штаммами

Все основные принципы лечения заболевания домашних условиях сводятся к общей схеме, которая изложена в отдельной статье.

Осложнения

Все штаммы COVID-19 могут приводить к развитию тяжелых форм заболевания или смерти, в особенности это касается наиболее уязвимых групп населения. У пациентов с критическим течением заболевания развивается эндотелиальная дисфункция, коагулопатия, тромбозы с наличием антител к фосфолипидам, с клинической картиной, напоминающей катастрофический антифосфолипидный синдром. Клинические и патологические изменения трудно дифференцировать с полиорганным тромбозом, развивающимся при ДВС-синдроме (синдроме диссеминированного внутрисосудистого свертывания) и тромботической микроангиопатии. Цитокиновый шторм при COVID-19, как правило, приводит к развитию острого респираторного дистресс-синдрома, полиорганной недостаточности и может быть причиной летального исхода.

После перенесенного Дельта-штамма коронавируса у женщин в 1,5-2 раза чаще, чем у мужчин стали наблюдаться абдоминальные симптомы: боли и спазмы в животе, тошнота, снижение аппетита, нарушения стула. Снижение фертильности отмечается как у женщин, так и у мужчин.

Поскольку Дельта-штаммом чаще, чем всеми предыдущими, заражаются молодые, мы можем наблюдать следующие редкие, но серьезные осложнения:

• постковидный синдром, который поражает центральную нервную систему и влияет на факторы иммунитета;
• мультисистемный воспалительный синдром у детей, который может вызвать воспаление жизненно важных органов, имея сходство с болезнью Кавасаки;
• повреждение микроскопических нервных волокон роговицы, прозрачного слоя перед зрачком.

Легкая форма течения коронавирусной инфекции, к которой чаще всего приводит Омикрон, способна вызвать достаточно серьезные изменения внутренней оболочки сосудов, проявляясь тромбозом сетчатки глаза. Часто пациенты жалуются на боль в глазах, расплывчатое изображение предметов, пятна перед глазами. Могут развиться такие симптомы, как внезапная боль в руках или ногах, судороги мышц (чаще ног), отеки нижних конечностей, патологическое расширение вен мелкого калибра. Свидетельством тромбоэмболии легочной артерии может стать кашель, неожиданно появившийся после выздоровления.

Профилактика новой коронавирусной инфекции, вызванной различными штаммами

Эволюция вирусов — это обычная вещь. С помощью вакцин человечество справилось со многими из них: была сведена к минимуму заболеваемость оспой, корью, паротитом, полиомиелитом и краснухой.

Вакцины действуют и на уровне антител, и на уровне Т-клеточного ответа. Антитела, если их достаточное количество, начинают работать еще до того, как вирус начал размножаться, то есть в момент его попадания в организм. Речь идет в первую очередь об

мРНК- и векторных вакцинах

.

Если эффективность вакцин против уханьского штамма достигала 95%, то в отношении варианта Дельта она снизилась, хотя сохраняется на уровне 90% (данные для вакцины «Спутник V»), что несколько выше, чем результаты, продемонстрированные зарубежными вакцинами BioNTech/Pfizer и Moderna (около 88%, согласно исследованиям, опубликованным в научном журнале Lancet). Еще ниже эффективность у AstraZeneca — 60%.

По данным ВОЗ, ряд исследований указывают на значительное снижение эффективности действия вакцины против штамма Омикрон по сравнению с Дельта-вариантом после двух доз вакцин Pfizer либо AstraZeneca. Спустя две недели после бустерной дозы вакцины эффективность действия препаратов против нового штамма повышается.

Ученые из ведущего итальянского института инфекционных заболеваний сравнили эффективность разных препаратов против Омикрон-штамма. «Спутник V» в два с лишним раза превосходит вакцину Pfizer. Анализ показал, что 74,2% сывороток крови у вакцинированных «Спутником V» и 56,9% сывороток крови у вакцинированных Pfizer содержали антитела к варианту Омикрон. Хорошие результаты демонстрирует ревакцинация «Спутником Лайт», причем в сочетании и с отечественными препаратами, и с зарубежными.

Источники:

1. Временные методические рекомендации. Профилактика, диагностика и лечение новой коронавирусной инфекции (СOVID-19). Версия 15 (22.02.2022), Министерство здравоохранения Российской Федерации. Утверждены заместителем министра Здравоохранения Российской Федерации А.Н. Плутницким. – 245 с.
2. Lucy G Thorne et al. Evolution of enhanced innate immune evasion by the SARS-CoV-2 B.1.1.7 UK variant/ bioRxiv 2021.06.06.446826v1; 
3. Campbell F, Archer B, Laurenson-Schafer H, Jinnai Y, Konings F, Batra N, et al. (June 2021). “Increased transmissibility and global spread of SARS-CoV-2 variants of concern as at June 2021”. Euro Surveillance. 26 (24): 2100509.
4. Finlay Campbell, Brett Archer, Henry Laurenson-Schafer, Yuka Jinnai, Franck Konings. Increased transmissibility and global spread of SARS-CoV-2 variants of concern as at June 2021 // Eurosurveillance. — 2021-06-17.
5. David N. Fisman, Ashleigh R. Tuite. Progressive Increase in Virulence of Novel SARS-CoV-2 Variants in Ontario// medRxiv. — 2021-08-04.
6. Lamiaa El-Shennawy et al. Circulating ACE2-expressing extracellular vesicles block broad strains of SARS-CoV-2// Nature communications (2022) 13:405.