Saga gis руководство пользователя на русском

Запуск¶

Для запуска ГИС SAGA с Live DVD кликните ярлык SAGA на рабочем столе.

Открыв SAGA первый раз, вы увидите 3 главных элемента интерфейса: Рабочую область, Свойства объекта и Окно сообщений. Информация в Свойствах объекта будет изменяться в соответствии с вашим выбором в Рабочей области.

../../_images/saga_guioverview10.png

Добавление данных¶

Откройте SAGA GUI и загрузите растр /home/user/saga/DGM_30m_Mt.St.Helens_SRTM.grd через меню File|Grid|Load Grid. На
вкладке General Окна сообщений вы получите сообщение об успешном или
неуспешном выполнении этой задачи. Вы должны увидеть что-то вроде Load Grid: DGM_30m_Mt.St.Helens_SRTM.grd…okay.
После загрузки набора данных он появится на вкладке Data Рабочей области.
Данные будут находиться в списке Grids в соответствии с системой координат файла.

В данном случае информация о системе координат выглядит как 30;312x 458y; 557970x 5108130y.
Первое число это — размер ячейки (30 метров), следующие два показывают количество ячеек в направлениях
x и y соответственно, а два последних — начало координат растра, которое в SAGA
обычно находится в нижнем левом углу. Эта и другая полезная информация
о наборе данных будет показана, если вы выберете вкладку Description окна Свойств объекта. После
открытия вкладки вы увидите не только более подробную информацию о системе координат растра,
но и тип его данных (здесь FLOAT), диапазон значений, некоторые статистические показатели
и размер занимаемого дискового пространства.

Визуализация данных¶

Для отображения данных в виде карты просто дважди кликните на соответствующем
наборе данных вкладки Data Рабочей области. Появится окно новой карты с добавленным
в него набором данных. Рамка отображает реальные координаты x и y на земной поверхности
в единицах измерения проекции данных. Двигая указатель мыши по карте, вы можете видеть,
как изменяются значения x-, y- и z-координат, отображающиеся на нижней панели SAGA.
Значения z-координаты отвечают отметкам абсолютной высоты набора данных (имейте в виду,
что отображающиеся значения всегда соответствуют тому набору данных, который выбран на
вкладке Data или Maps).

Теперь воспользуйтесь инструментами навигации для увеличения и передвижения карты.
Инструмент Zoom выбран по умолчанию. Левый клик мыши по карте увеличивает масштаб отображения,
а правый — уменьшает. Протягивание по диагонали карты курсора с удерживанием в нажатом состоянии
левой кнопки мыши позволяет увеличить масштаб отображения определённого фрагмента. Если вы
продолжите увеличивать масштаб отображения, то сможете увидеть отдельные ячейки растра. Для
передвижения изображения воспользуйтесь инструментом Pan, нажав и протягивая указатель мыши
вместе с изображением. Обратите внимание и на другие кнопки панели инструментов: они позволяют
вам изменить масштаб отображения, например, до полного охвата — Full Extent.

../../_images/saga_fullextent10.png

Tip

SAGA увеличивает масштаб отображения очень быстро, поэтому если вы растерялись, просматривая свои данные, просто кликните на панели инструментов кнопку Zoom to Full Extent.

Создание растра светотеневой отмывки рельефа¶

Улучшим визуализацию данных, рассчитав карту теневой отмывки рельефа. Перейдите на
вкладку Modules Рабочей области и кликните на символе плюса слева от
библиотеки Terrain Analysis — Lightning, Visibility: появится
список входящих в нее модулей. Теперь выберите модуль Analytical Hillshading и перейдите на
вкладку Settings окна Свойств объекта. В ней отображаются параметры модуля (обратите также внимание на вкладку Description, которая содержит подробную информацию о модуле и его параметрах). Кликните в правой колонке параметра Grid system (там где отображается [not set]) и выберите систему координат набора данных Mt. St. Helens. Далее кликните в правой колонке параметра Elevation и выберите ваш набор данных. В правой колонке опции Shading Method выберите Standard. Теперь нажмите кнопку Apply, а затем — Execute. В результате будут рассчитаны значения теневой отмывки.

Проверьте вкладку Рабочей области Data — вы увидите только что созданный набор данных. Дважды кликните по набору данных Analytical Hillshading и выберите New в диалоговом окне. Набор данных отобразится в окне новой карты. После изучения набора данных закройте окно карты, выбрав Close из меню Window.

Теперь снова дважды кликните по набору данных с теневой отмывкой, но в открывшемся диалоговом окне выберите карту, уже содержащую высотные данные (Add layer to selected map). В результате растр теневой отмывки рельефа наложится на слой абсолютных высот.

Перейдите на вкладку Maps Рабочей области. Вы увидите содержимое вашей карты и наборы данных, из которых она состоит, в порядке их отрисовки — снизу вверх. Кликните правой кнопкой мыши по набору данных Analytical Hillshading и выберите Move To Bottom из появившегося контекстного меню. Это изменит порядок отрисовки, переместив слой аналитической отмывки под слой абсолютных высот (который теперь снова станет видимым в окне карты). Выберите набор данных абсолютных высот (кликом левой кнопки мыши) и обратите внимание на вкладку Settings окна Свойств объекта. Перейдите к секции параметров Display и кликните в правой колонке опции Transparency. Введите значение 30 и нажмите кнопку Apply. Теперь вы можете увидеть значения абсолютной высоты, оттененные с помощью аналитической отмывки.

Попробуйте другие настройки Transparency или же Shading Methods в модуле Analytical Hillshading (в случае, если вы не измените параметры результирующего набора данных, изменения будут записаны в уже созданный растр, т.е. вы сразу же увидите результат на карте).

../../_images/saga_withhillshade10.png

3D-визуализация¶

Возможно, далее вы захотите визуализировать ваши данные в 3D. Проверьте, чтобы было выбрано окно соответствующей карты и нажмите на панели инструментов кнопку Show 3D-View. В появившемся диалоговом окне выберите систему координат, которая соответствует набору данных абсолютных высот и установите Mt. St. Helens в качестве параметра Elevation. После нажатия кнопки Okay появится 3D-вид вашей карты. Удерживайте нажатой левую кнопку мыши и двигайте указатель для вращения и наклона поверхности. Используйте правую кнопку мыши для увеличения/уменьшения масштаба отображения и движения поверхности. Обратите внимание на панель инструментов 3D-вида: кнопки повторяют функции мыши и дают дополнительные возможности. Для закрытия 3D-вида выберите Close в меню Window.

../../_images/saga_3d10.png

Построение изолиний¶

В качестве краткого знакомства с возможностями SAGA по работе с векторными данными построим
горизонтали на основе цифровой модели рельефа. Это можно сделать с помощью
Shapes — Grid | Contour Lines From Grid, если вы откроете вкладку модулей в рабочей области,
или же с помощью меню Modules|Shapes|Grid|Vectorization. Установите систему координат вашего растра и собственно растр
(это должна быт абсолютная высота). Дальнейшие установки можно оставить без изменений, однако лучше изменить высоту сечения рельефа на 50м вместо стандартных 10м.
Несколько секунд спустя создастся слой изолиний, который можно увидеть, перейдя на вкладку данных Рабочей области. Откройте его в новой карте. Все горизонтали имеют один и тот же цвет, что не очень удобно. Если вы выберете свой набор данных (вкладка данных рабочей области) и посмотрите на вкладку Settings окна свойств объекта, то увидите раздел Display: color classification. Здесь можно изменить способ классификации “Unique symbol” на градуированный цвет. После этого необходимо указать высоту в качестве атрибута на основе которого будут изменяться цветовые значения. Нажмите применить, чтобы увидеть цветные горизонтали.

Проверка истории¶

Выбрав набор данных (например, изолинии) на вкладке Рабочей области, можно перейти на вкладку history окна Свойств объекта, чтобы увидеть какие модули и с какими настройками были использованы для создания этого набора данных. Эта информация также записывается во время сохранения файлов (в файлах с расширениями .hshp и .hgrd).

../../_images/saga_contour_history10.png

Сохранение данных¶

Для того, чтобы сохранить результаты работы, перейдите на вкладку данных Рабочей области и кликните правой кнопкой мыши по файлу, который вы собираетесь сохранить. SAGA сохранит растровые файлы в собственном формате (*.sgrd) а векторные — в общепринятом ESRI shapefile (*.shp). Выбрав File|Project|Save Project, можно сохранить проект — это опция позволит сохранить все карты и настройки визуализации данных, а также предложит сохранить непосредственно все файлы данных.

Импорт/Экспорт данных¶

Для импорта и экспорта данных существуют различные модули. Наиболее полезный из них — Import/Export GDAL/OGR, который расположен в меню modules|file|GDAL/OGR. С использованием этого модуля можно импортировать большое число растровых форматов, в т.ч. GeoTIFF. Этот же модуль может быть использован и для экспорта данных в различные растровые форматы.

Tip

формат растровых данных SAGA ГИС поддерживается GDAL, начиная с версии 1.7.0. Благодаря этому растровые файлы, сохраненные в SAGA, могут быть открыты и другими программами, использующими GDAL. Однако, для этого нужно открывать файл с расширением ‘*.sdat’ а не ‘*.sgrd’.

В этом примере мы используем данные цифровой модели рельефа SRTM для территории неподалёку от г. Барселоны.

Файл данных, который мы хотим использовать (SRTM_u03_n041e002.tif), находится
в директории /home/user/data/raster. Его можно импортировать с помощью модуля Import/Export GDAL/OGR, расположенного в меню modules|file|GDAL/OGR.

После импорта набора данных и открытия его в новом окне, вы, вероятно, будете разочарованы: он же весь серый! Проверим, что тому причиной: некоторые пиксели возле побережья имеют очень маленькие значения (-32768) (проверить значения пикселей можно с помощью Z: чисел на панели статуса, которые изменяются во время перемещения курсора мыши по карте).

На самом деле эти пиксели не имеют значений, поэтому нам следует откорректировать параметры отсутствующих данных: в окне свойств объекта (после выбора набора данных в окне рабочей области), установите максимальное значения отсутствующих данных равным “-32768” и нажмите кнопку Apply.
После этого мы можем установить цветовую шкалу в соответствии с диапазоном значений данных. Проще всего это сделать правым кликом мыши по растру в рабочей области, выбрав из контекстного меню “Classification|Set Range to minimum maximum”.

Теперь вы готовы к тому чтобы повторить вышеописанные шаги по созданию карты теневой отмывки рельефа или же исследовать другие модули SAGA!

tags

Free

Saga GIS (System for Automated Geoscientific Analyses) is a GIS application for spatial data editing and GIS analyses. It can be used with a graphical user interface, command line tools or through the R package Rsagacmd or RSAGA. Since the RSAGA package is no longer actively maintained and has not been tested on newer SAGA GIS versions, we recommend using Rsagacmd with SAGA GIS 7.9.0 and higher.

Available

SAGA GIS is available in Puhti in r-env module with different versions.

Usage

SAGA GIS command line interface

r-env is an Apptainer container, which means the commands are slightly different compared normal installations, basically all commands need to have apptainer_wrapper exec before the usual command.

SAGA GIS command line tools can be used in an interactive session or batch jobs.

You can test that SAGA GIS loaded successfully and print the command line tools help information with

module load r-env
apptainer_wrapper exec saga_cmd -h

For more information on running R jobs on Puhti, please see the r-env documentation.

SAGA GIS Graphical User Interface

The easiest option for using SAGA GIS is to open it in Puhti web interface as Desktop app.

  1. Log in to Puhti web interface.
  2. Start SNAP: Apps -> Desktop, choose Desktop: ‘single application’ and App: ‘SAGA GIS’
  3. The SNAP GUI is started automatically when the Desktop is launched.

Alternatively, especially if you want to use SAGA GIS together with some other GUI tool or want to user older version, SAGA GIS can be started in Puhti web interface with remote desktop:

  1. Log in to Puhti web interface.
  2. Open Remote desktop: Apps -> Desktop, choose Desktop: mate or xfce.
  3. After launcing the remote desktop, double-click SAGA GIS icon OR open Host Terminal (Desktop icon) and start SAGA GIS:
module load r-env
apptainer_wrapper exec saga_gui

License and acknowledgement

SAGA GIS is published under the GPL license.

Please acknowledge CSC and Geoportti in your publications, it is important for project continuation and funding reports.
As an example, you can write «The authors wish to thank CSC — IT Center for Science, Finland (urn:nbn:fi:research-infras-2016072531) and the Open Geospatial Information Infrastructure for Research (Geoportti, urn:nbn:fi:research-infras-2016072513) for computational resources and support».

References

  • SAGA GIS homepage
  • SAGA GIS page on Sourceforge
  • SAGA GIS tutorials
  • SAGA GIS tutorials on Sourceforge

О книге «Применение цифровых технологий SAGA GIS в почвенных и экологических исследованиях. . Учебное пособие.»

Учебное пособие предназначено для студентов факультета почвоведения Московского государственного университета имени М.В.Ломоносова, обучающихся по направлениям «Почвоведение», «Экология и природопользование». В пособии приводятся алгоритмы построения цифровых почвенных карт, а также методы анализа изображений с использованием большого количества инструментов, входящих в программу SAGA GIS. В настоящее время SAGA (System for Automated Geoscientific Analyses) является одной из наиболее сильных ГИС аналитической направленности и активно используется в почвоведении, экологии и географии. Большая привлекательность этого программного обеспечения обусловлена его свободным доступом и открытым исходным кодом. Пособие восполняет острую необходимость справочных материалов на русском языке, которые пока отсутствуют в документации к данной программе. Помимо этого, в пособие включены разделы по совместному использованию SAGA GIS и базы данных Postgresql, не документированные в официальном руководстве на английском языке. Существенным достоинством пособия является раздел, посвященный автоматизации работы в программе с использованием командных строк, реализованный на конкретном примере анализа изображения почвенного профиля. Данное пособие может быть полезно научным работникам, специалистам в области охраны природы и экологического прогнозирования, студентам и аспирантам естественных и агрономических факультетов вузов, использующих методы ГИС-анализа и цифровые технологии программно-вычислительного комплекса SAGA (System for Automated Geoscientific Analyses) в работе с пространственно-распределенными данными.

Произведение относится к жанру Геология. Оно было опубликовано в 2022 году издательством Кнорус. На нашем сайте можно скачать книгу «Применение цифровых технологий SAGA GIS в почвенных и экологических исследованиях. . Учебное пособие.» в формате fb2, rtf, epub, pdf, txt или читать онлайн. Здесь так же можно перед прочтением обратиться к отзывам читателей, уже знакомых с книгой, и узнать их мнение. В интернет-магазине нашего партнера вы можете купить и прочитать книгу в бумажном варианте.

May 21 2013, 19:36

Продолжаем знакомиться с SAGA — осваиваем инструментарий работы с шейп-файлами: создание, редактирование, расчет пространственных характеристик и кое-что другое в новой статье.

Почитать / Обсудить

PS  не забудьте заглянуть в репозиторий и обновиться свеженьким релиз-кандидатом версии 2.1.0 от 17/05/2013

Originally published at GIS-Lab Blog. You can comment here or there.

Учебное пособие предназначено для студентов факультета почвоведения Московского государственного университета имени М.В.Ломоносова, обучающихся по направлениям «Почвоведение», «Экология и природопользование».

В пособии приводятся алгоритмы построения цифровых почвенных карт, а также методы анализа изображений с использованием большого количества инструментов, входящих в программу SAGA GIS.

В настоящее время SAGA (System for Automated Geoscientific Analyses) является одной из наиболее сильных ГИС аналитической направленности и активно используется в почвоведении, экологии и географии. Большая привлекательность этого программного

обеспечения обусловлена его свободным доступом и открытым исходным кодом.

Пособие восполняет острую необходимость справочных материалов на русском языке, которые пока отсутствуют в документации к данной программе. Помимо этого, в пособие включены разделы по совместному использованию SAGA GIS и базы данных Postgresql, не

документированные в официальном руководстве на английском языке. Существенным достоинством пособия является раздел, посвященный автоматизации работы в программе с использованием командных строк, реализованный на конкретном примере анализа изображения

почвенного профиля.

Данное пособие может быть полезно научным работникам, специалистам в области охраны природы и экологического прогнозирования, студентам и аспирантам естественных и агрономических факультетов вузов, использующих методы ГИС-анализа и цифровые технологии

программно-вычислительного комплекса SAGA (System for Automated Geoscientific Analyses) в работе с пространственно-распределенными данными.

Понравилась статья? Поделить с друзьями:
  • Препарат трулисити цена инструкция по применению отзывы
  • Как поставить на учет мотоцикл через госуслуги пошаговая инструкция
  • Газовая плита флама 4 конфорки с духовкой инструкция по применению
  • Инструкция для candy goy 105 07s
  • Амоксиклав инструкция по применению взрослым суспензия дозировка